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Apport de la génétique pour une meilleure connaissance des populations naturelles et une amélioration des populations cultivées d'huîtres plates et creuses ArchiMer
Lapegue, Sylvie.
In the framework of the French diploma "Habilitation à Diriger des Recherches", Sylvie Lapègue's synthesis of research includes ten years (1998-2007) of work in bivalve genetics, and mainly cupped and flat oysters. This research has been developed in (1) flat oyster population genetics at the European level and cupped oyster populations and species genetics at a global scale, (2) the characterization of a cytogenetic particularity observed in oysters that corresponds to a high rate of aneuploidy in somatic cells, and (3) more recently in the use of molecular markers for the construction or improvement of genetic maps, allowing (4) the identification of areas of the genome related to the resistance to summer mortality in the Pacific oyster and the...
Tipo: Text Palavras-chave: Ostrea; Crassostrea; Oysters; QTLs; Genetic maps; Breeding; Aneuploidy; Population genetics; Ostrea; Crassostrea; Huître; QTLs; Cartes génétiques; Amélioration; Aneuploïdie; Génétique des populations.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/these-3478.pdf
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Endonuclease banding reveals that atrazine-induced aneuploidy resembles spontaneous chromosome loss in Crassostrea gigas ArchiMer
Bouilly, Karine; Leitao, Alexandra; Chaves, Raquel; Guedes Pinto, Henrique; Boudry, Pierre; Lapegue, Sylvie.
Aneuploidy has previously been observed in the Pacific oyster, Crassostrea gigas, and shown to be negatively correlated with growth. Moreover, a significant impact of atrazine exposure has been described in C. gigas, and persistence of that effect has been observed between generations. Evidence of differential chromosome loss has been demonstrated in aneuploid karyotypes of C. gigas using the G-banding technique. Pairs 1, 5, 9, and 10 are characterized by the loss of 1 chromosome. As restriction enzyme (RE) digestion chromosome banding allows a better identification of chromosome pairs, we used this technique to identify which chromosomes are affected when aneuploidy is increased by exposure to atrazine. The progeny of oysters contaminated by atrazine were...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea gigas; Pacific oyster; Restriction enzyme digestion chromosome banding; Atrazine; Aneuploidy; Crassostrea gigas; Huître creuse; Marquage chromosomique par digestion d'enzymes de restriction; Atrazine; Aneuploïdie.
Ano: 2005 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/2005/publication-654.pdf
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Etude des anomalies chromosomiques chez Crassostrea gigas ArchiMer
Lapegue, Sylvie; Mccombie, Helen; Leitao, Alexandra; Bouilly, Karine; Sabatier, Sebastien; Heurtebise, Serge; Boudry, Pierre; Thiriot, Catherine; Gerard, Andre.
Divers travaux menés depuis 1984 montrent qu'il existe, chez l'huître creuse Crassostrea gigas, des cellules montrant un nombre anormal de chromosomes (2n = 19, 18 ou même 17 au lieu de 2n = 20). Le niveau d'aneuploïdie est déterminé par le décompte des chromosomes à partir de suspensions cellulaires de tissu branchial. Le pourcentage de cellules aneuploïdes est toujours significativement supérieur dans les "lots de queue", c'est-à-dire les huîtres présentant des croissances plus faibles, et peut atteindre plus de 30 %. Récemment, une étude réalisée au sein du programme européen « Genephys » a démontré que plus de 50 % de la variance pour la vitesse de croissance était liée au taux d'aneuploïdie. Cependant, de nombreux points concernant ce phénomène...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Chromosomes; Anomalies; Aneuploïdie; Atrazine; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00199/31013/29417.pdf
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Etude des anomalies chromosomiques chez Crassostrea gigas - Contrat de Plan Région Poitou-Charentes 2000-2006. Convention 2000 ArchiMer
Lapegue, Sylvie; Mccombie, Helen; Leitao, Alexandra; Bouilly, Karine; Sabatier, Sebastien; Heurtebise, Serge; Boudry, Pierre; Thiriot Quievreux, Catherine; Gerard, Andre.
Divers travaux menés depuis 1984 montrent qu’il existe, chez l’huître creuse Crassostrea gigas, des cellules montrant un nombre anormal de chromosomes (2n = 19, 18 ou même 17 au lieu de 2n = 20). Le niveau d’aneuploïdie est déterminé par le décompte des chromosomes à partir de suspensions cellulaires de tissu branchial. Le pourcentage de cellules aneuploïdes est toujours significativement supérieur dans les "lots de queue", c'est-à-dire les huîtres présentant des croissances plus faibles, et peut atteindre plus de 30 %. Récemment, une étude réalisée au sein du programme européen « Genephys » a démontré que plus de 50 % de la variance pour la vitesse de croissance était liée au taux d’aneuploïdie. Cependant, de nombreux points concernant ce phénomène...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Chromosomes; Aneuploïdie; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15474/12853.pdf
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Etude des anomalies chromosomiques chez Crassostrea gigas - Contrat Région Poitou-Charentes 2000-2006. Convention 2002 ArchiMer
Bouilly, Karine; Mccombie, Helen; Leitao, Alexandra; Lapegue, Sylvie.
Divers travaux menés depuis 1984 montrent qu’il existe, chez l’huître creuse Crassostrea gigas, des cellules montrant un nombre anormal de chromosomes (2n = 19, 18 ou même 17 au lieu de 2n = 20). Le niveau d’aneuploïdie est déterminé par le décompte des chromosomes à partir de suspensions cellulaires de tissu branchial. Le pourcentage de cellules aneuploïdes est toujours significativement supérieur dans les "lots de queue", c'est-à-dire les huîtres présentant des croissances plus faibles, et peut atteindre plus de 30 %. Cette corrélation négative entre l’aneuploïdie somatique et le taux de croissance a été décrite à de nombreuses reprises (Thiriot-Quiévreux et al., 1988, 1992 ; Leitão et al., 2001a ; Zouros et al., 1996). Bien que les causes...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Chromosomes; Aneuploïdie; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15475/12854.pdf
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Etude des anomalies chromosomiques chez Crassostrea gigas - Contrat Région Poitou-Charentes 2000-2006. Convention 2003 ArchiMer
Bouilly, Karine; Bonnard, Marc; Grouhel, Stephanie; Lapegue, Sylvie.
Divers travaux menés depuis 1984 montrent qu’il existe, chez l’huître creuse Crassostrea gigas, des cellules présentant un nombre anormal de chromosomes (2n = 19, 18 ou même 17 au lieu de 2n = 20). Or, une corrélation négative entre l’aneuploïdie somatique et le taux de croissance a été décrite à de nombreuses reprises (Thiriot-Quiévreux et al., 1988, 1992 ; Leitão et al., 2001a ; Zouros et al., 1996). Bien que les causes environnementale et /ou génétique de l’aneuploïdie restent encore largement inconnues, des études récentes ont permis de poser l’hypothèse d’une base génétique large dans la détermination de ce caractère (Leitão et al., 2001b). De plus, un effet toxique direct de l’atrazine (herbicide couramment utilisé dans la région) sur le génome d’une...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Chromosomes; Aneuploïdie; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2003 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15476/12855.pdf
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Etude des anomalies chromosomiques chez Crassostrea gigas - Contrat Région Poitou-Charentes 2000-2006. Convention 2004 ArchiMer
Bouilly, Karine; Bonnard, Marc; Lapegue, Sylvie.
Des anomalies cytogénétiques, telles que l'aneuploïdie, sont connues pour être communes chez les bivalves (Ahmed et Sparks, 1970; Dixon, 1982; Thiriot- Quiévreux, 1986; Martínez-Expósito et al., 1992; Li et Havenhand, 1997). Ce phénomène, qui a pour origine principalement une non-disjonction des chromosomes pendant la mitose ou la méiose (Bond et Chandley, 1983; Martin et Rademaker, 1990), est souvent létal chez les animaux supérieurs tels que les mammifères ou bien associé à un retard de croissance (Vig et Sandberg, 1987). Chez Crassostrea gigas, l’aneuploïdie est l’altération du nombre diploïde normal de 20 chromosomes (Ahmed et Sparks, 1967; Thiriot-Quiévreux, 1984) en cellules hypodiploïdes avec 19, 18 ou 17 chromosomes (Thiriot-Quiévreux et al.,...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Chromosomes; Aneuploïdie; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15477/12856.pdf
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Etude des anomalies chromosomiques chez Crassostrea gigas. Contrat Région Poitou-Charentes 2000-2006. Convention 99 ArchiMer
Lapegue, Sylvie; Mccombie, Helen; Leitao, Alexandra; Heurtebise, Serge; Boudry, Pierre; Thiriot Quievreux, Catherine; Gerard, Andre.
Divers travaux menés depuis 1984 montrent qu’il existe, chez l’huître creuse Crassostrea gigas, des cellules montrant un nombre anormal de chromosomes (2n = 19, 18 ou même 17 au lieu de 2n = 20). Le niveau d’aneuploïdie est déterminé par le décompte des chromosomes à partir de suspensions cellulaires de tissu branchial. Le pourcentage de cellules aneuploïdes est toujours significativement supérieur dans les "lots de queue", c'est-à-dire les huîtres présentant des croissances plus faibles, et peut atteindre plus de 30 %. Récemment, une étude réalisée au sein du programme européen « Genephys » a démontré que plus de 50 % de la variance pour la vitesse de croissance était liée au taux d’aneuploïdie. Cependant, de nombreux points concernant ce phénomène...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Chromosomes; Aneuploïdie; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2000 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00043/15473/12852.pdf
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Etude du niveau d'aneuploïdie dans les populations des zones de captage du bassin de Marennes-Oléron - Contrat Plan Etat Région Poitou-Charentes 1999 - Rapport 1999 ArchiMer
Lapegue, Sylvie; Thiriot Quievreux, Catherine; Mccombie, Helen; Heurtebise, Serge; Boudry, Pierre; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick; Goulletquer, Philippe; Gerard, Andre.
Divers travaux, menés depuis 1984, montrent qu'il existe, chez l'huître creuse Crassotrea gigas, des cellules montrant un nombre anormal de chromosomes (2n = 19, 18 ou même 17 au lieu de 2n = 20). Le niveau d'aneuploïdie est déterminé par le décompte des chromosomes à partir de suspensions cellulaires de tissu branchial. Le pourcentage de cellules aneuploïdes est toujours significativement supérieur dans les "lots de queue", c'est-à-dire les huîtres présentant des croissances plus faibles, et peut atteindre plus de 30 %. Récemment, une étude réalisée au sein du programme européen « Genephys » a démontré que plus de 50 % de la variance pour la vitesse de croissance était liée au taux d'aneuploïdie. Le but de l'expérimentation menée en 1999 est de faire un...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Aneuploïdie; Génétique des populations; Biochimie; Marennes-Oléron; Huître creuse; Crassostrea gigas.
Ano: 1999 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15522/12909.pdf
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Evidence of differential chromosome loss in aneuploid karyotypes of the Pacific oyster, Crassostrea gigas ArchiMer
Leitao, Alexandra; Boudry, Pierre; Thiriot Quievreux, Catherine.
The G-banding technique was performed on aneuploid karyotypes from gill tissue of the Pacific oyster, Crassostrea gigas, to assess whether chromosome losses could be explained by differential chromosomal susceptibility and to clarify the negative correlation between aneuploidy and growth rate previously reported in different populations of this oyster. The study of 95 G-banded aneuploid karyotypes showed that only 4 of the 10 chromosome pairs (viz. 1, 5, 9, and 10) of C. gigas were affected by the loss of one homologous chromosome. Pairs 1, 9, and 10, which were lost in 56, 33, and 44% of cases, respectively, may be considered to be differentially affected. Hypotheses on this differential chromosomal susceptibility are discussed.
Tipo: Text Palavras-chave: Oyster; Karyotype; G banding; Growth; Aneuploidy; Huître; Caryotype; Bandes G; Croissance; Aneuploïdie.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-742.pdf
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Experimental evidence for a genetic basis to differences in aneuploidy in the Pacific oyster (Crassostrea gigas) ArchiMer
Leitao, Alexandra; Boudry, Pierre; Mccombie, Helen; Gerard, Andre; Thiriot-quievreux, Catherine.
Aneuploidy has been previously reported in wild and cultivated Pacific oysters, Crassostrea gigas, and has been shown to be negatively correlated with growth. This is especially important since high variability of growth rate is one of the major problems in the aquacultural production of this species. The existence of a genetic basis for the observed differences in aneuploidy was first investigated through the comparative study of six full-sib families, with mean individual weights ranging from 0.59 to 1.49 g. The slowest growing family was found to have the highest level of aneuploidy. Significant differences in aneuploidy were also found among families when individuals with the same growth rate were sampled. This supports the hypothesis of the existence...
Tipo: Text Palavras-chave: Oyster; Growth; Genetics; Full sib families; Crassostrea gigas; Aneuploidy; Huître; Croissance; Génétique; Famille de plein frères; Crassostrea gigas; Aneuploïdie.
Ano: 2001 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-2700.pdf
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Impact de facteurs environnementaux sur l'aneuploïdie chez l'huître creuse, Crassostrea gigas, dans le bassin de Marennes-Oléron ArchiMer
Bouilly, Karine.
The impact of environmental factors on aneuploidy level in the oyster Crassostrea gigas was studied with experiments in controlled conditions which exposed adult and juvenile oysters to different pollutants (atrazine, a herbicide, and cadmium, a heavy metal) frequently found in Marennes-Oléron Bay. A positive correlation between atrazine concentration and aneuploidy in C. gigas was observed. Moreover, the impact of atrazine on aneuploidy level persisted in time both within and between generations, demonstrating the influence of an environmental pollution on this phenomenon. On the other hand, the aneuploidy level of C. gigas was not influenced at the cadmium concentrations tested. Significant differences in aneuploidy levels were observed in oysters...
Tipo: Text Palavras-chave: Marennes Oléron Bay; Cadmium; Atrazine; Environmental factors; Aneuploidy; Crassostrea gigas; Bassin de Marennes Oléron; Cadmium; Atrazine; Facteurs environnementaux; Aneuploïdie; Crassostrea gigas.
Ano: 2004 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2004/these-326.pdf
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Influence des facteurs environmentaux sur l'aneuploïdie chez l'huître creuse, Crassostrea gigas ArchiMer
Baffard, Vincent.
Différents travaux menés depuis 1984 chez l'huître creuse en particulier, montrent qu'i existe, dans les branchies (Thiriot-Quiévreux C., 1982), une certaine proportion de cellules possédant un nombre de chromosomes inférieur au nombre habituel 2N=20. Ce phénomène est l'aneuploïdie. Cette anomalie cytogénétique est mise en évidence par un comptage de chromosomes d'une suspension cellulaire obtenue à partir de branchies. Il est apparu que le taux d'aneuploïdie affectait négativement les taux de croissance (Leitao & al. 2001). Il existe deux types d'origines possibles à l'aneuploïdie. La première peut être génétique (Leitao & al. 2001), et la seconde environnementale. L'effet de l'atrazine sur l'aneuploïdie a déjà fait l'objet de travaux. Il existe...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Aneuploïdie; Huître creuse; Crassostrea gigas; Mercure; Cadmium; Atrazine; Impact.
Ano: 2002 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14405/11698.pdf
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Le phénomène de l'anauploïdie et sa relation avec la croissance chez l'huître creuse Crassostrea gigas ArchiMer
Leitao, Alexandra; Boudry, Pierre; Mccombie, Helen; Lapegue, Sylvie; Gerard, Andre; Thiriot-quievreux, Catherine.
Cytogenetic abnormalities have often been observed on bivalves on meiosis or mitosis. This is a review of various observations of somatic aneuploidy conducted on different populations of Crassastrea gigas.
Tipo: Text Palavras-chave: Croissance; Aneuploïdie; Huîtres; Génétique; Crassostrea gigas; Cytogénétique.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/acte-3280.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2008 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Hubert, Mathias; Cantin, Christian; D'Amico, Florence; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
Le suivi de la ploïdie du naissain capté dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et d'Arcachon a été réalisé par cytométrie en flux . Les échantillons de naissain naturel ont été prélevés sur 3 sites dans chaque bassin et pour un total de 1002 animaux analysés. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l 'absence d'animaux polyploïdes. triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Ces résultats sont conformes aux prévisions en la matière et n'apportent donc aucune raison de modification des pratiques en cours dans la filière ostréicole triploïde. Cependant, pour la deuxième année consécutive, les deux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Reproduction; Captage; Ploïdie; Aneuploïdie; Marennes Oléron; Arcachon; Crassostrea gigas.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18131/15679.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2010 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Guyader, Tanguy; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
Le réseau biovigilance a réalisé en 2010 la caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2009 dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon. Les échantillons des naissains sauvages issus du captage naturel ont été prélevés sur 4 sites dans chaque bassin et pour un total analysé de 1379 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l'absence d 'animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Cependant, les deux bassins de captage prospectés sont caractérisés par la présence de naissains affectés de diverses anomalies génomiques: cassures d 'ADN et Aneuploïdie (hypodiploïdie) ADN c à d une diminution de la taille du...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Reproduction; Captage; Ploïdie; Anomalie génomique; Aneuploïdie.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18124/15677.pdf
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Pollution et taux d'aneuploïdie chez l'huître creuse Crassostrea gigas: étude expérimentale sur une population en milieu contrôlé ArchiMer
Bouilly, Karine.
Aneuploidy has previously been reported in wild and cultivated Pacific oysters, Crassostrea gigas, and it has been shown to be negatively correlated with growth. This is especially important since high variability of growth rate is one of the major problems in the aquacultural production of this species. The existence of an environmental factor (such as atrazine contamination) with an effect on aneuploidy level was first investigated through the study of a population of Crassostrea gigas subjected to different concentrations of atrazine. The treatments applied represent peak values found in the environment (0,01 mg/l) plus a value ten times higher (0,1 mg/l). Our results have shown that although atrazine did not have an effect on the mortality of adult...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Aneuploïdie; Facteur environnemental; Atrazine; Aneuploidy; Pacific oysters; Crassostrea gigas; Environmental factor; Atrazine.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00428/53932/55060.pdf
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Pollution et taux d'aneuploïdie chez l'huître creuse Crassostrea gigas : étude expérimentale sur une population en milieu contrôlé ArchiMer
Sabatier, Sebastien.
Le bassin de Marennes-Oléron, milieu fortement anthropisé, souffre d'une diminution générale du taux de croissance des huîtres creuses, Crassostrea gigas. Si les fortes densités existants dans le bassin sont grandement responsables de ce phénomène, d'autres facteurs environnementaux peuvent intervenir. Nous nous sommes intéressés à un caractère corrélé négativement à la croissance, le taux d'aneuploïdie. Il s'agit d'un phénomène cytogénétique ayant pour conséquence la perte ou le gain de chromosomes. Dans cette étude, une expérimentation en écloserie a été mise en place afin de tester l'effet de l'atrazine (herbicide très utilisé et se retrouvant en quantité importante dans le bassin) sur le taux d'aneuploïdie de naissains d'huîtres. Les valeurs testées...
Tipo: Text Palavras-chave: Crassostrea gigas; Naissain; Aneuploïdie; Environnement; Atrazine; Anthropisation.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14408/11701.pdf
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